دکتر جعفریان در چهل و سومین گزارش ماهانه خود و اولین گزارش در سال 96، تأکید کرد اتمام برنامه 4 ساله در پایان این دوره یک ضرورت است و به موضوع مدیریت دوره بعدی در دانشگاه ارتباطی ندارد.

در گزارش ماهانه چهل و دوم رییس دانشگاه که آخرین گزارش در سال 95 هم هست، آمده است: نام بهار طراوت و نو شدن را با خود به همراه دارد و این به‌خودی‌خود شادی‌آفرین است. اینک که پس از یک سال کار و تلاش مداوم، با وقفه‌ای کوتاه خود را برای سال جدید آماده می‌کنیم نگاهی به آنچه گذشت مصداقی است از این کلام که: «حاسبوا قبل ان تحاسبوا».

دکتر علی جعفریان، رییس دانشگاه به مناسبت روز 22 اسفند روز «گرامي داشت شهدا» در پیامی از جایگاه رفیع معنوی آنان تجلیل کرد.

رییس دانشگاه در گزارش ماهانه چهل و یکم خود، با تاکید براینکه همه‌ی نظرات کاربران را می‌خواند و از محتوای آنها استفاده می‌کند، نوشت: همکاران آسوده خاطر باشند که مطالبشان حتی آنهایی که در سایت منعکس نمی‌شود را می‌بینم.

«در گزارش چهلم طعم تلخ بر شیرین غالب شد و این ذات دنیایی است که ما در آن زندگی می‌کنیم؛ «یک روز برای ما و یک روز علیه ما» برای همه شما دانشگاهیان عزیز روزهای شیرین و دور از غبارهای زشتی و پلشتی آرزو می‌کنم.»

در پی رحلت آیت الله اکبر هاشمی رفسنجانی، هیأت رئیسه دانشگاه علوم پزشکی تهران در پیامی این فقدان تأسف بار را تسلیت گفت.

دکتر سید حسن هاشمی، وزیر بهداشت در نامه‌ای به دکتر علی جعفریان، از اجرای موفق سامانه یکپارچه بهداشتی کشور (سیب) در دانشگاه علوم پزشکی تهران تشکر کرد.

روسای دانشگاه‌ها و دانشکده‌های علوم پزشکی سراسر کشور با ارسال نامه‌ای به نمایندگان مجلس شورای اسلامی، از توجه ویژه آنها به نتایج ارزشمند طرح تحول نظام سلامت تشکر کردند.‌

دکتر علی جعفریان، رییس دانشگاه همچون ماه های گذشته در پایان آذرماه 95 در گزارشی مکتوب با دانشجویان، کارکنان و اعضای هیئت‌علمی دانشگاه سخن گفت.

گزارش آبان ماه 95 رییس دانشگاه به دانشجویان، کارکنان و هیئت‌علمی، کمی با گزارش‌های دیگر او متفاوت است؛ گزارش این ماه دکتر جعفریان تحت تأثیر طرح تحول نظام سلامت قرار دارد و به جنبه خدمات بهداشتی درمانی بیشتر از فعالیت‌های دانشگاهی پرداخته شده است.